Sezon 1, Odcinek 1: Pilot
Data Premiery – 13 Wrzesień 2005

Agent FBI Booth potrzebuje pomocy doktor Brennan, aby rozwiązać sprawę rozłożonych zwłok znalezionych w stawie cmentarza w Arlington. Brennan zgadza się pomóc, ale pod warunkiem iż będzie równoprawnym partnerem w sprawie.

Sezon 1, Odcinek 2: The Man in the SUV
Data Premiery – 20 Wrzesień 2005

Bones zostaje wezwana aby zidentyfikować ciało podejrzanego o samobójczy zamach samochodowy.

Sezon 1, Odcinek 3: A Boy in a Tree

Data Premiery – 27 Wrzesień 2005

Bones z Boothem prowadzą śledztwo w sprawie ciała nastolatki zwisającego z drzewa, na terenie ekskluzywnej prywatnej szkoły.

Sezon 1, Odcinek 4: The Man in the Bear
Data Premiery – 1 Listopad 2005

Bones z Boothem udają się w podróż do Washingtonu aby sprawdzić do kogo należy ręka znaleziona w martwym czarnym niedźwiedziu.

Sezon 1, Odcinek 5: A Boy in a Bush
Data Premiery – 8 Listopad 2005

Kiedy mały chłopiec gubi się w centrum handlowym, Bones zostaje wezwana aby sprawdzić czy to jego ciało zostało znalezione w pobliskim placu.

Sezon 1, Odcinek 6: The Man in the Wall
Data Premiery – 15 Listopad 2005

Wspólny wieczór Bones z Angelą okazuje się niewypałem, kiedy Bones odkrywa zmumifikowane zwłoki i torbę z amfetaminą.

Sezon 1, Odcinek 7: The Man on Death Row
Data Premiery – 22 Listopad 2005

Prawnik skazanego, odwołuje się w ostatniej chwili od wyroku, prosząc Bones i Bootha o ponowne zbadanie tej sprawy. W czasie poszukiwania śladów, dochodzą do wniosku iż mężczyzna może być niewinny.

Sezon 1, Odcinek 8: The Girl in the Fridge
Data Premiery – 29 Listopad 2005

Bones z Boothem prowadzą sprawę zaginionej kobiety znalezionej w lodówce, podzas gdy Bones spotyka swojego byłego profesora.

Sezon 1, Odcinek 9: The Man in the Fallout Shelter
Data Premiery – 13 Grudzień 2005

Kiedy gang jest objęty kwarantanną, trwają poszukiwania rozwiązania zagadki szkileletu znalezinego w schronisku.

Sezon 1, Odcinek 10: The Woman at the Airport
Data Premiery – 25 Styczeń 2006

Bones z Boothem ruszają do LKos Angeles, aby rozwiązać sprawę ciała znalezionego na plaży.
Dochodzenie prowadzi ich do prostytutek oraz chirurgów plastycznych.

Sezon 1, Odcinek 11: The Woman in the Car
Data Premiery – 1 Luty 2006

Doszczętnie zwęglone zwłoki kobiety w samochodzie są zidentyfikowanue jako ciało żony geeniusza Carla Deckera.

Sezon 1, Odcinek 12: The Superhero in the Alley
Data Premiery – 8 Luty 2006

Bones z Boothem prowadzą sprawę zwłok ubranych w kostium. Sprawa prowadzi ich do zaginionego nastolatka, komiksów i gier.

Sezon 1, Odcinek 13: The Woman in the Garden
Data Premiery – 15 Luty 2006

Bones z Boothem zajmują się sprawą ciała kobiety znalezionego w samochodzie członka gangu.
Sprawa prowadzi ich wprost do niebezpiecznego gangu.

Sezon 1, Odcinek 14: The Man on the Fairway
Data Premiery – 8 Marzec 2006

Bones zostaje poproszona o pomoc w katastrofie samolotowej, gdzie zginęli chińscy delegatowie, ale bardziej interesują ją kawałki kości które nie leżały w pobliżu samolotu. Należały one do człowieka zaginionego od 5 lat.

Sezon 1, Odcinek 15: Two Bodies in the Lab
Data Premiery – 15 Marzec 2006

Bones zostaje postrzelona w klubie, ale udaje jej się ujść z życiem.

Sezon 1, Odcinek 16: The Woman in the Tunnel
Data Premiery – 22 Marzec 2006

Śmierć twórcy filmów dokumentalnych prowadzi Bones i Bootha do tunelów pod miastem.

Sezon 1, Odcinek 17: The Skull in the Desert
Data Premiery – 29 Marzec 2006

Brennan idzie z pomocą Angeli, kiedy jej chłopak zaginął na pustyni. Do akcji włącza się Booth, kiedy miejscowy szeryf nie chce współpracować.

Sezon 1, Odcinek 18: The Man with the Bone
Data Premiery – 5 Kwiecień 2006

Booth i Bones rozwiązują sprawę pirackiego skarbu.

Sezon 1, Odcinek 19: The Man in the Morgue
Data Premiery – 19 Kwiecień 2006

Bones udaje się do Nowego Orleanu, mieszając się w morderstwo z elementami Voodoo.

Sezon 1, Odcinek 20: The Graft in the Girl
Data Premiery – 26 Kwiecień 2006

Podczas badania ciała młodej dziewczyny, Brennan i Booth odkrywają coś dziwnego.

Sezon 1, Odcinek 21: The Soldier on the Grave
Data Premiery – 10 Maj 2006

Booth i Brennan prowadzą dochodzenie w sprawie samobójstwa które może prowadzić do wielkiego skandalu wojskowego.

Sezon 1, Odcinek 22: The Woman in Limbo
Data Premiery – 17 Maj 2006

Spośród wielu osób w archiwach, jedna z nich okazuje się od dawna zaginioną matką Brennan.